La ubiquitina (Ub) es ubicua. Esta pequeña proteína de 76 residuos se utiliza para marcar las proteínas celulares para su degradación por el sistema de proteasomas de ubiquitina (UPS).Ubi ligasas y enzimas de desbiquitilización (DUB), son responsables de poner y quitar estas unidades Ub y controlar la población proteica general de la célula.y la desregulación puede conducir a una serie de cosas malasPor lo tanto, comprender las relaciones entre la actividad de DUB o Ub ligasa y enfermedades específicas sería útil para diseñar inhibidores u otras intervenciones terapéuticas.Se han desarrollado varias sondas basadas en Ub para el perfil de proteínas basadas en la actividad (ABPP)., que suele incluir una etiqueta de afinidad, como la hemaglutinina (HA) o la biotina, en el extremo N y una ojiva electrofílica en el extremo C, como la propargilamida (PA), el éster metilvinílico (VME),o deshidroalanina (Dha)Sin embargo, muchas de estas sondas se limitan a experimentos con proteínas recombinantes purificadas o lisatos celulares debido a la mala penetración celular.Las sondas realmente necesitan ser capaces de entrar en las células y reaccionar con enzimas intracelulares con el fin de obtener la información más útil para la orientación de fármacos y otros esfuerzos.

• Las cadenas de ubiquitina de diferentes longitudes y tipos se pueden aplicar a funciones bioquímicas como la interacción y la actividad enzimática, así como al estudio de la biología estructural de los cristales,microscopios electrónicos y resonancia magnética nuclear.
• Las sondas de enlace cruzado derivadas de la ubiquitina pueden usarse para detectar proteínas desconocidas que interactúan de células normales o enfermas y nuevos objetivos para el tratamiento de enfermedades adversas.
• Las sondas fluorescentes derivadas de ubiquitina pueden utilizarse para analizar la actividad y especificidad de la deubiquitinasa y la detección de alto rendimiento de los inhibidores de la deubiquitinasa.